九州大学はタイの13大学と全学および部局間の協定を結んでいる。チュラロンコン大学、マヒドン大学、タマサート大学、泰日工業大学の4大学と大学間学術協定を、チュラロンコン大学、マヒドン大学、タマサート大学の3大学と大学間学生協定を締結している。

本学の共創学部は、チュラロンコン大学の統合イノベーション学部と部局間学術協定および学生協定、マヒドン大学のインターナショナルカレッジと部局間学生協定を締結し、国際交流を深めている。

本学の薬学部は、チュラロンコン大学、マヒドン大学、コンケーン大学などの薬学部と部局間学生協定を締結し、学生の交流を進めている。また、熱帯農学研究センターや農学研究院が中心となって、カセサート大学の農学部や水産学部、林学部などの８学部、チェンマイ大学の農学部、キングモンクット工科大学トンブリ校の大学院生物資源及び技術学府と部局間学術協定および学生協定を締結し、農学関連の共同研究を広く推進している。
本学の工学研究院は学内の他部署・センターと共同で、チェンマイ大学やキングモンクット工科大学の２校、スラナリー工科大学の工学部等と部局間学術協定および学生協定を締結し、様々な工学関連分野の共同研究を進めている