九州大学はシンガポールの2大学と協定を結んでいる。シンガポール国立大学とは、大学間学生協定を締結しており、工学、芸術工学、農学ほかの分野で様々な共同研究が進められている。
本学の先導物質化学研究所との共同研究が進められた実績が見られる。また、アジア人の腸内フローラ研究が本学やシンガポール国立大学などのアジア各国の大学との共同研究として広範に進められている。
南洋理工大学とは、大学間学術協定を締結するとともに、本学の芸術工学研究院が人文芸術社会科学カレッジ アート・デザイン・メディア学部と部局間学生協定を締結し、交流を進めている